玉米丝黑穗病发病的主要原因：一是土壤中病菌大量积累和带菌田的扩大；二是感病品种的种植；三是早播和出苗期的持续土壤低温气候为病害发生创造了适宜的环境条件。

玉米丝黑穗病综合防治方法主要有：

1、选用优良抗病品种。不同的品种对玉米丝黑穗病的抗性差异较大，种植抗病品种是长期控制玉米丝黑穗病的根本措施。引进品种要做好抗病试验，禁止未审先推。

2、加强栽培管理，合理密植。适时播种，播种时深浅适宜，合理密植，促苗早发，培育壮苗，增强品种抗性，减少感染的机会，注意氮、磷、钾肥的配合使用，避免偏施氮肥，浇水要及时，特别是抽雄前后易感染期必须保证水分充足，及时防治玉米螟虫等害虫，人工去雄尽量不要造成大伤口，均可减轻病害。

3、播前进行种子处理。须选择内吸性强，残效期长的药，以保证防治效果。应注意种衣剂的有效成分要含有烯唑醇、戊唑醇和三唑醇三种药剂之一。生产上播前用15％粉锈宁拌种，用药量为种子量的0.4％

4、拔除病株。玉米丝黑穗病的早期特异症状从幼苗3～4叶期即开始表现。随着叶龄的增加，症状特征愈明显，确诊率愈高。在苗期可结合间苗、定苗及中耕除草等剔除病苗、可疑苗。拔节至抽穗期，病菌黑粉未散落前拔除病株扫残。病株要深埋、烧毁，不要在田间随意丢放。

5、化学防治。在发病初期每亩用15%粉锈宁150～200克，对水50公斤喷雾防治；或在玉米抽雄前用50％的福美双可湿性粉剂500-800倍液进行喷雾，防治1-2次，可减轻丝黑穗病的发生。在重病区在防治虫害的同时适当增加一些杀菌剂如多菌灵、甲基托布津等也能取得明显的防治效果。